Управление МБОУ «Прогимназия «Эврика» осуществляется в соответствии с федеральными законами, иными нормативными правовыми актами и Уставом учреждения на основе сочетания принципов единоначалия и коллегиальности.

Единоличным исполнительным органом МБОУ «Прогимназия «Эврика» является директор, который осуществляет текущее руководство деятельностью учреждения.
Со 2 декабря 2016 года директором МБОУ «Прогимназия «Эврика» является Юханова Мария Валериановна.

В МБОУ «Прогимназия «Эврика» формируются коллегиальные органы управления:

  • Общее собрание работников учреждения,
  • Педагогический совет,
  • Совет Учреждения.

Структурные подразделения МБОУ «Прогимназия «Эврика» (в том числе филиалы, подразделения, службы, представительства и др.) – не имеются.